Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms