Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTK7Q13308 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms