Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
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CLN3Q13286 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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CLN3Q13286 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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CLN3Q13286 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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CLN3Q13286 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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CLN3Q13286 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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