Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMD2Q13200 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms