Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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