Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFX1Q12986 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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