Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CDH17Q12864 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CDH17Q12864 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CDH17Q12864 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CDH17Q12864 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CDH17Q12864 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CDH17Q12864 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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