Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TROQ12816 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TROQ12816 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TROQ12816 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TROQ12816 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TROQ12816 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TROQ12816 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TROQ12816 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TROQ12816 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TROQ12816 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TROQ12816 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TROQ12816 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TROQ12816 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TROQ12816 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TROQ12816 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TROQ12816 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TROQ12816 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TROQ12816 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TROQ12816 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TROQ12816 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TROQ12816 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TROQ12816 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TROQ12816 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TROQ12816 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TROQ12816 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TROQ12816 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TROQ12816 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TROQ12816 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TROQ12816 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TROQ12816 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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