Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms