Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms