Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TGM3Q08188 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms