Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN1Q04323 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms