Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms