Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OXCT1P55809 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms