Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms