Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DAP3P51398 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DAP3P51398 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms