Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA4P48058 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms