Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PBX2P40425 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBX2P40425 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PBX2P40425 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBX2P40425 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBX2P40425 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBX2P40425 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBX2P40425 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBX2P40425 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBX2P40425 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBX2P40425 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBX2P40425 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBX2P40425 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBX2P40425 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBX2P40425 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PBX2P40425 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBX2P40425 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PBX2P40425 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBX2P40425 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PBX2P40425 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms