Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITGAEP38570 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms