Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZEB1P37275 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZEB1P37275 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms