Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 321.5 ms