Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL9P32969 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL9P32969 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL9P32969 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL9P32969 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL9P32969 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL9P32969 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL9P32969 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL9P32969 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL9P32969 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL9P32969 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL9P32969 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL9P32969 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL9P32969 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL9P32969 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL9P32969 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL9P32969 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL9P32969 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL9P32969 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL9P32969 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL9P32969 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL9P32969 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL9P32969 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms