Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TSPOP30536 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms