Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CRABP1P29762 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms