Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms