Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMLP26374 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMLP26374 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMLP26374 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMLP26374 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMLP26374 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMLP26374 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMLP26374 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMLP26374 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMLP26374 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMLP26374 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMLP26374 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMLP26374 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMLP26374 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMLP26374 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMLP26374 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMLP26374 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMLP26374 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMLP26374 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHMLP26374 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHMLP26374 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHMLP26374 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHMLP26374 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHMLP26374 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CHMLP26374 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHMLP26374 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMLP26374 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMLP26374 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHMLP26374 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMLP26374 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMLP26374 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMLP26374 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMLP26374 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMLP26374 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHMLP26374 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMLP26374 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMLP26374 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMLP26374 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMLP26374 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMLP26374 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMLP26374 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMLP26374 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMLP26374 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHMLP26374 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHMLP26374 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms