Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP1P23763 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC243972.2-201ENST00000541653 991 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms