Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP4AP20648 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP4AP20648 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms