Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPAN8P19075 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms