Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPCAMP16422 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms