Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms