Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ACTN1P12814 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ACTN1P12814 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms