Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKAP2O75563 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SKAP2O75563 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SKAP2O75563 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms