Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXTL3O43909 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms