Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms