Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms