Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms