Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms