Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC78A2IDD5 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms