Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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