Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEU3Q9UQ49 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms