Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGSF9BQ9UPX0 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms