Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEPT3Q9UH03 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms