Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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COPS7AQ9UBW8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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