Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LHX3Q9UBR4 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms