Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms