Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD5Q9P267 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD5Q9P267 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms