Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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