Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PKDREJQ9NTG1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms