Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms